Merhaba,
Öncelikle
www.domain.com DNS serverdan nereyi görüyor onu kontrol etmelisin.
ns1.vpsipsi.com Name
server'ın (VPS'deki DNS
server'ın) içinde
www.domain.com'a ilişkin bir kayıt varmı?
Varsa vps ip'sinin dışında bir IP döndürüyormu?
Ek olarak
web server üzerinde (Apache olduğunu varsayıyorum) virtual host tanımlamalısın.
http://httpd.apache.org/docs/2.0/vhosts/examples.html adresinde gerekli örneklere ulaşabilirsin.
Son olarak: Bir kontrol paneli kullanırsan çok daha hızlı yapılandırabilirsin. (Plesk,CPanel,Helm gibi)